La REDU se organiza de la siguiente manera:

a) Asamblea General: conformada por los rectores y rectoras con voz y voto, y/o delegados con voz;

b) Presidencia: ejercida por uno de los rectores o rectoras electos por la Asamblea General;

c) Comité Ejecutivo: conformado por la Presidencia y dos rectores o rectoras electos por la Asamblea General, o sus delegados; y la Coordinación con voz.

d) Coordinación de REDU.